mi sa tanto che la centralina deve essere in qualche modo "resettata" visto che è stata staccata la batteria.

è molto probabilmente un fatto normale, quello che ti è occorso, e molto probabilmente la procedura per "riattivare" l'auto è scritta nel manuale uso e manutenzione, ma forse devi avere sottomano anche il codice che ti è stato fornito insieme alle chiavi.

il più delle volte queste "anomalie" sono il normale funzionamento dei dispositivi di protezione antifurto.

ed è sempre bene che ci siano.

Può darsi che, staccando il positivo, il cavo abbia toccato o sfiorato il telaio dell'auto o una parte a massa dell'auto, ancora collegata al negativo della batteria, causando un corto circuito, magari te la cavi con qualche fusibile briuciato.